¿Qué hacemos en Xenogene?

¿Que se hace en Xenogene y por qué es distinto a lo demás?

Ante todo Feliz año nuevo a to2.

En este nuevo año 2019 queremos despegar con nuestra actividad y llegar a sitios donde aún no hemos llegado. Creemos que nuestra técnica podría ser de utilidad y de ayuda en muchos casos de infección en los que los médicos se quedan atascados.

Tal y como explicaba en la primera entrada de este blog, en Xenogene se realiza un servicio de detección de microorganismos en muestras biológicas... pero lo hacemos de una forma muy distinta a lo que se hace ahora, usamos una técnica que debería revolucionar la microbiología clínica.

Hoy en día, cualquiera que vaya al médico y tengan que tratarle para alguna infección, se les pide un cultivo o una PCR o un Malditoff para detectar lo que está causando la infección... Con suerte (o mala suerte, según se mire) es posible que pidan Secuenciación en caso de no poder sacar lo que es con las técnicas anteriores y  hagan la secuenciación por 16S en caso de sospecha de bacterias o un 18S en caso de sospecha de hongos. 

Gracias a Dios, existe una lista de patógenos sospechosos habituales y se tratan y ya está. ¿Pero qué pasa con los que no son habituales? Pues se empiezan a hacer estudios eliminando candidatos uno a uno, o unos pocos a la vez. Los ensayos más complejos que se hacen pueden detectar unos 20 especies distintas o cerca de 40 subtipos en casos de los kits de los Papilomavirus (por ejemplo). Si alguien viene con una infección de otro país, es posible que tampoco sea uno de los habituales aquí en España.

Nuestra técnica se basa en la Metagenómica, que lo que se trata es pillar TODO el material genético de una muestra y por secuenciación masiva, detectarlo. Este material genético es el material humano, bacteriano, fúngico, vírico, parasitario y de cualquier ser vivo que deje su material genético en la muestra. Este tipo de análisis aún no se aplica en microbiología clínica. Si hay una sospecha de una infección y no se sabe o se sospecha que es lo que está produciendo la infección, se podría usar esta técnica.

Una vez hecha la secuenciación, llega la parte más complicada... LA BIOINFORMÁTICA...

La secuenciación puede generar una cantidad de información bestial (sobre todo en unas muestras como puede ser unas heces o sangre en las que hay muchísima cantidad de DNA). hay que optimizar y tener unos equipos potentes para poder procesar toda la información que genera el secuenciador.

La ventaja que tenemos es que lo hacemos en un tiempo de 48 horas desde que recibimos la muestra, cosa que cualquier técnica que use secuenciación de tercera generación tardaría más tiempo.

Para complementar este blog, estamos trabajando en una Wiki con información relacionada con nuestro campo de interés. Aun está en pañales, pero algo hemos avanzado ya. Os dejo el enlace a continuación:
http://wiki.xenogene.es/index.php?title=P%C3%A1gina_principal

¡Espero que tengáis to2 un buen 2019!